Основные направления работы отдела:

· Осуществление организационного, правового и методологического обеспечения контрольной деятельности Минобрнауки России;

· Осуществление методологического обеспечения деятельности Контрольно-ревизионного департамента, направленного на совершенствование системы внутреннего контроля в подведомственных Минобрнауки России организациях и повышение ее эффективности;

· Обеспечение взаимодействия Контрольно-ревизионного департамента с государственными органами контроля и надзора, правоохранительными органами по вопросам рассмотрения материалов проверок подведомственных Минобрнауки России организаций;

· Рассмотрение обращений граждан и организаций по вопросам, входящим в компетенцию Контрольно-ревизионного департамента.